关于 28335 eQEP模块例程

现在想用eQEP模块以及编码器（E6A2-CW3C）测量电机的转速，使用Example_28..xEqep_pos_speed例程。

例程中说

// GPIO20/EQEP1A <- GPIO0/EPWM1A (simulates EQEP Phase A signal)
// GPIO21/EQEP1B <- GPIO1/EPWM1B (simulates EQEP Phase B signal)
// GPIO23/EQEP1I <- GPIO4 (simulates EQEP Index Signal)

把GPIO0/EPWM1A、GPIO1/EPWM1B 作为模拟输入。

GPIO20/EQEP1A、GPIO21/EQEP1B这两个我接的实际编码器的输出A、B两相，已确定电机旋转时编码器可以输出相位差为90度的方波（不连接DSPGPIO20/EQEP1A、GPIO21/EQEP1B时）

然而将编码器的A、B两相输出接到GPIO20/EQEP1A、GPIO21/EQEP1B引脚之后，只有一相可以检测到方波信号，另一相信号消失？

请问大神这是为什么？

在InitEQepGpio()中，GPIO20和GPIO21设置完全相同，怎么会出现这种情况？